عصر ایران- آیت الله موسوی بجنوردی معتقد است: «تغییر جنسیت دخالت در خلقت خداوند نیست بنا براین هیچ مشکل شرعی ندارد و تا زمانی که قانون گذار حکم بر حرام بودن مساله ای ندهد ما حق نداریم بدون دلیل آن را حرام اعلام کنیم.»
نشریه حریم امام (متعلق به آستان مقدس امام خمینی) که با این فقیه گفت و گو کرده نوشته است: « در فقه امامیه یک بحثی وجود دارد که اساس هر چیزی حرام است، مگر این که دلیلی بر جواز وجود داشته باشد یا این که اساس هر چیزی حلال است و حرمت آن دلیل می خواهد. به عبارت بهتر، من فقیه وقتی بخواهم چیزی را حرام کنم باید یک دستور العمل خاص وجود داشته باشد که این عمل حرام است و اگر نه اگر دلیلی وجود ندارد نباید آن را حرام اعلام کنم زیرا اصل هر چیزی حلال است.»
آیت الله موسوی بجنوردی تصریح کرده است:« حضرت امام، از آن دسته مراجعی است که بر این باور است که این کار جایز است چه ضرورت داشته باشد و چه ضرورت نداشته باشد.»
او درباره مهریه زنانی که تغییر جنسیت می دهند نیز گفته است: « مهریه با تغییر جنسیت ساقط نمی شود. چون این خانم مدت زمانی همسر این آقا بوده است.»
دیدگاه فقیهان در قبال مقوله « تغییر جنسیت » بر سه دسته است: مخالفت کلی، موافقت در صورت اضطرار و بدون اشکال شرعی(امام خمینی، در گروه اخیر قرار دارد.)