حضرت آيت‌الله خامنه‌اي در پيامي به مراسم تجليل از سركار حاجيه خانم همايوني در اصفهان، وي را از مفاخر جامعه‌ي زنان ايران اسلامي دانستند و تاكيد كردند: «حضور تحصيلكردگان معارف ديني و قرآني در حد ايشان نشان‌دهنده‌ي آمادگي و استعداد زن ايراني براي پيمودن مدارج عاليه علم و معرفت ديني است.»
به گزارش ايسنا، متن پيام رهبر معظم انقلاب به اين شرح است:
«بسم الله الرحمن الرحيم
سركار حاجيه خانم همايوني جزو مفاخر جامعه‌ي زنان ايران اسلامي است. حضور تحصيلكردگان معارف ديني و قرآني در حد ايشان نشان‌دهنده‌ي آمادگي و استعداد زن ايراني براي پيمودن مدارج عاليه علم و معرفت ديني است.
بانوي بزرگوار استاد ايشان مرحومه سركار حاجيه خانم امين در عصر خود آيتي از استعداد و استقامت و ظرفيت‌هاي بالاي ذهني زنان تحصيلكرده ديني ما بوده است. رحمت خداوند بر ايشان باد. اكنون نيز ادامه‌ي كار آن بانوي بزرگوار بوسيله سركار حاجيه خانم همايوني مايه‌ي خرسندي است و اميد است با حضور ايشان به نحو شايسته و كامل در گسترش معارف اسلامي ميان بانوان استفاده شود.
سلامتي و طول عمر ايشان را از خداوند متعال مسئلت مي‌نمايم.»
سيدعلي خامنه‌اي
١٩/فروردين/١٣٩٠