این کلیسا که در سال ۱۹۹۴ به همت دولت شیلی به عنوان اثر ملی شناخته شده بود بر اثر آتش‌سوزی فرو ریخت. کلیسای سان فرانسیسکو در شمال شیلی بیشتر از چوب ساخته شده بود و با وجود تلاش ۱۲ واحد آتش‌نشانی، شعله‌های آتش آن را به تلی از خاکستر تبدیل کرد. منشا آغاز آتش‌سوزی در دست بررسی است.